Миссия: невыполнима

События фильма происходит в 2000 году. Начальник ЦРУ в Праге получает кассету, на которой записано задание для подразделения IMF. Его суть заключается в слежке за возможным предателем. Его имя – Александр Голицын. Он собирается передать список секретных агентов для продажи неизвестному человеку по имени Макс. Руководитель пражского подразделения собирает свою команду. Его правая рука – Итан Хант. В состав группы также входит жена Итана – Клэр, кибер-хакер — Джек Хармон, наблюдательница Ханна и шпионка – Сара Дэйвис.

Обсудив дальнейшие действия, отряд отправляется реализовывать намеченный план. Но что-то пошло не так, и сообщники умирают один за другим. Предполагаемый террорист – Галицын, тоже становится жертвой. Хант осознает, что он остался один, а убийце удалось выкрасть диск с именами агентов. Шпион винит себя в случившемся, но начальство пытается убедить его в обратном. Вскоре Итан понимает, что его окружают представители его же организации, только принадлежащие к другому отделу. Он догадывается, что стал частью большой игры. Их миссия была лишь прикрытием для более масштабной операции. Он сам попадает под подозрение. Его цель – найти настоящего преступника, чтобы спасти свою любимую, себя самого и доказать свою невиновность.