Сюжет третий части фильма рассказывает о влюбленных Беатрис Прайор и Тобиасе, которым удалась выбраться вместе с приятелями за пределы Чикаго. Молодые люди решительно настроены раскрыть правду, понять, что находится за стенной которая длительное время ограждала их от внешнего мира. Но судьба преподносит друзьям новые сюрпризы, вместо, долгожданной свободы они попадают в Бюро Генетической Защиты.
Главные герои раскрывают страшные секреты, оказывается в далеком прошлом началась генетическая война за чистое общество. В результате чего человечество разделилось на очищенных особей и поврежденных. Ученые настолько одержимы данной идеей, что стали проводить эксперименты на людях. Создавая искусственные сообщества, внедряя в них агентов, прошедших тщательный отбор. Цель проекта создать потомство с чистыми генами. Узнав такие шокирующие подробности Трис приходит в ужас. Ее парень пытается повлиять на происходящее, вследствие чего оказывается в очередной передряге. Чем разозлил ученых, у которых все было на готовности, они собирались сделать перезагрузку, стерев память всем жителям города. Удастся отважным дивергентам разрушить систему и спасти мир от безумных экспериментаторов, предстоит узнать.