На первый взгляд, Томас Андерсон — простой обыватель, ничем не отличающийся от серой массы городских жителей. Каждое утро он отправляется на работу, корпит над бумагами и получает выговоры от начальства. Парень ненавидит свой офис, вечно сплетничающих коллег и глупого и взбалмошного босса. Возвращаясь домой, он садится за компьютер и... превращается в гениального хакера под ником Нео.
Однажды он получает странное сообщение, которое заставляет героя всерьез задуматься. А вскоре приходит к выводу, что вся существующая вокруг него реальность — не более чем картинка-иллюзия, созданная Искусственным Интеллектом. Люди, живущие своей обычной жизнью, на самом деле являются лишь источниками энергии для высокоразвитых умных машин, контролирующих каждый шаг своих подопечных.
Андерсон решает разорвать этот порочный круг. Погрузившись в иную реальность, он надеется добраться до главного виновника сложившейся ситуации. На своем пути герой сталкивается с поразительными вещами — отсутствием гравитации, безграничными возможностями собственного тела, уникальными способностями мозга к усвоению огромных пластов информации. А еще обретает новых друзей, с помощью которых постигает окружающую его Матрицу...